تأسیس‌شده در دی‌ماه ۱۳۷۵، این مرکز به‌عنوان یکی از نخستین نهادهای پژوهشی در حوزه بهداشت باروری در کشور، با تمرکز بر سلامت جسمی، روانی و اجتماعی زنان و خانواده در تمام مراحل زندگی فعالیت می‌کند. مأموریت اصلی آن ارتقاء سلامت باروری، پیشگیری از ناباروری، بهبود کیفیت خدمات سلامت جنسی و باروری، و انجام پژوهش‌های کاربردی در راستای توسعه پایدار و بهبود شاخص‌های سلامت جمعیت است.

این مرکز در مردادماه ۱۳۸۸ با هدف ارتقاء سلامت مادران و نوزادان و کاهش عوارض بارداری‌های پرخطر، مرگ‌ومیر مادران و نوزادان، و معلولیت‌های دوران کودکی تأسیس شد. فعالیت‌های آن شامل پژوهش‌های بنیادی، اپیدمیولوژیک و بالینی، ارائه خدمات مشاوره ژنتیکی، تشخیص پیش از تولد، جراحی جنین، مراقبت‌های پس از زایمان و آموزش‌های تخصصی برای ارتقاء آگاهی مادران است. این مرکز با بهره‌گیری از متخصصان برجسته، در مسیر تبدیل‌شدن به یکی از قطب‌های علمی و پژوهشی منطقه گام برمی‌دارد.

این مرکز با هدف ترویج، حمایت و ارتقاء تغذیه با شیر مادر و انجام پژوهش‌های تخصصی در این حوزه فعالیت می‌کند. تمرکز اصلی آن بر بررسی علمی مزایای تغذیه با شیر مادر، تدوین راهنماهای بالینی، آموزش کادر درمانی، و ارتقاء آگاهی عمومی در زمینه تغذیه نوزادان است. این مرکز همچنین در طراحی و اجرای برنامه‌های ملی و منطقه‌ای برای بهبود تغذیه نوزادان نقش فعالی ایفا می‌کند.